Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms