Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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