Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms