Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9CRC3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms