Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms