Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Txndc9Q9CQ79 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Txndc9Q9CQ79 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms