Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms