Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms