Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg3Q9CPX6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms