Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim3Q99PE5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim3Q99PE5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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