Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem2Q99NH8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms