Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b1Q99NB9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms