Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl43Q99N89 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms