Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms