Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a9Q99MR3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms