Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprtQ99M80 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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PtprtQ99M80 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PtprtQ99M80 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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