Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpd3Q99LY2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms