Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Nus1Q99LJ8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Nus1Q99LJ8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Nus1Q99LJ8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nus1Q99LJ8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms