Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms