Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms