Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms