Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lims1Q99JW4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lims1Q99JW4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lims1Q99JW4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lims1Q99JW4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lims1Q99JW4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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