Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms