Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim7Q923T7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms