Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf3Q922U1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms