Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi2Q920Q6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms