Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Setd3Q91WC0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd3Q91WC0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms