Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usb1Q91W78 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms