Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hps3Q91VB4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms