Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms