Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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