Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpa1Q8VEE4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpa1Q8VEE4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms