Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RhovQ8VDU1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms