Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnajc28Q8VCE1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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