Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Med17Q8VCD5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Med17Q8VCD5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms