Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf4Q8R368 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms