Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r200Q8R281 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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