Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg10Q8R1P4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms