Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4T3

Stradb, STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StradbQ8K4T3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
StradbQ8K4T3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
StradbQ8K4T3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms