Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r72Q8K3N7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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