Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5rap2Q8K389 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms