Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc12Q8K2L8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc12Q8K2L8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms