Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms