Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Polr1eQ8K202 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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