Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn34c1Q8K193 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms