Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms