Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms