Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vps37aQ8CHS8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vps37aQ8CHS8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms