Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ep400Q8CHI8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ep400Q8CHI8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms