Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1l1Q8CGM2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1l1Q8CGM2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms